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  1. 01 雑誌論文等
  2. FEMS Microbiology Ecology

Custom-made medium approach for effective enrichment and isolation of chemolithotrophic iron-oxidizing bacteria

https://oacis.repo.nii.ac.jp/records/2000706
https://oacis.repo.nii.ac.jp/records/2000706
0b7d9e86-1cdf-4f20-8479-3939b617bf31
Item type 学術雑誌論文 / Journal Article(1)
公開日 2025-09-09
タイトル
タイトル Custom-made medium approach for effective enrichment and isolation of chemolithotrophic iron-oxidizing bacteria
言語 en
言語
言語 eng
キーワード
主題 custom-made medium, enrichment, Gallionellaceae, iron-oxidizing bacteria, isolation
資源タイプ
資源タイプ journal article
アクセス権
アクセス権 metadata only access
著者 Uchijima, Tomoki

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書誌情報 en : FEMS Microbiology Ecology

巻 101, 号 6, p. fiaf051, 発行日 2025-06-01
抄録
内容記述 Chemolithotrophic neutrophilic iron (Fe)-oxidizing bacteria, which mainly belong to the family Gallionellaceae, universally prevail in terrestrial environments changing Fe cycling. However, they are typically recognized as difficult-to-culture microbes. Despite efforts, there are few Fe(II)-oxidizing lithotroph isolates; hence, their physiological and ecological knowledge remains limited. This limitation is largely owing to difficulties in their cultivation, and we hypothesize that the difficulty exists because substrate and mineral concentrations in the cultivation medium are not tuned to a specific environmental condition under which these organisms live. To address this hypothesis, this study proposes a novel custom-made medium approach for chemolithotrophic Fe(II)-oxidizing bacteria; a method that manipulates medium components through diligent analysis of field environment. A new custom-made medium simulating energy substrates and nutrients under the field condition was prepared by modifying both chemical composition and physical setup in the glass-tube medium. In particular, the modification of the physical setup in the tube had a significant effect on adjusting dissolved Fe(II) and O2 concentrations to the field environment. Using the medium, Gallionellaceae members were successfully enriched and a new Gallionellaceae species was isolated from a natural hot spring site. Compared with conventional medium, the custom-made medium has significantly higher ability in enriching Gallionellaceae members.
内容記述
内容記述 公開日: 2025-05-05
ISSN
収録物識別子タイプ PISSN
収録物識別子 0168-6496
書誌レコードID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AA10517278
DOI
関連タイプ isVersionOf
識別子タイプ DOI
関連識別子 https://doi.org/10.1093/femsec/fiaf051
情報源
関連識別子 https://academic.oup.com/femsec/article/101/6/fiaf051/8126031
関連名称 Publisher's Version/PDF (Open Access)
情報源
関連識別子 https://academic.oup.com/femsec/article/101/6/fiaf051/8126031
関連名称 Oxford University Press
出版者
出版者 Oxford University Press
科学研究費研究課題
言語 ja
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03087/
主題 最先端X線分光法を駆使した水田土壌表層へのヒ素濃集機構の解明と土壌修復への応用
科学研究費研究課題
言語 en
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03087/
主題 Study on arsenic accumulation mechanism in surface layer of paddy soils using advanced X-ray spectroscopy and its application to soil remediation technique
科学研究費研究課題
言語 ja
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-19H04302/
主題 鉱山廃棄物の持続的な安定化に向けた有害金属の微生物ー鉱物相互作用の解明
科学研究費研究課題
言語 en
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H04302/
主題 Microbial-mineral interactions of toxic metals for stabilization of mine waste
科学研究費研究課題
言語 ja
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19871/
主題 微生物電気化学プロセスを活用した持続可能な汚染浄化と新規ナノ材料創生技術の開発
科学研究費研究課題
言語 ja
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-23K27042/
主題 水田土壌表層へのヒ素異常濃集を支配する複合要因の解明と自然模倣型土壌浄化への応用
科学研究費研究課題
言語 en
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23K27042/
主題 Investigation of complex factors controlling arsenic accumulation in surface paddy soils and its application to nature-mimetic soil remediation
科学研究費研究課題
言語 ja
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-23H00534/
主題 SDGsバイオ技術開発:微生物電気化学プロセスによる持続的な汚染浄化と金属回収
科学研究費研究課題
言語 en
主題URI https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23H00534/
主題 SDGs Biotechnology Development: Sustainable Pollution Remediation and Metal Recovery through Microbial Electrification Processes
研究課題番号
内容記述 19H03087
研究課題番号
内容記述 19H04302
研究課題番号
内容記述 21K19871
研究課題番号
内容記述 23K27042
研究課題番号
内容記述 23H00534
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Ver.1 2025-09-08 07:48:09.276919
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